Programa,
cronograma, diapositivas, etc.
Material
complementario del curso (guia de ejercicios de practico, lecturas complementarias,
etc.)
Mini-foro
Docentes
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CRONOGRAMA
DEL CURSO
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programa
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tema
de la clase |
salón |
hora |
material
(pdf) |
I. INTRODUCCIÓN |
| 6/10 |
- Breve introducción del tema 'bioinformática'.
- Aspectos prácticos necesarios para seguir apropiadamente
el curso:
·
Introducción al sistema operativo Unix.
·
Uso de algunas herramientas de Internet (ftp, telnet, e-mail)
·
Rudimentos de Windows y programas básicos (planillas electrónicas,
procesadores de texto, paquetes estadísticos).
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14:30 |
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II. RECURSOS
EN INTERNET |
| 13/10 |
-
Información, software y 'servers'.
- Bases de datos biológicas en la WWW.
- Buscando en las bases de datos.
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III. ANÁLISIS
DE SECUENCIAS INDIVIDUALES |
| 20/10 |
-
Análisis de secuencias de nucleotídicas (frecuencias
de bases, uso de codones, búsqueda de motivos, diseño
de primers, patrones de restricción, etc.)
- Análisis de secuencias proteicas (frecuencia de aminoácidos,
perfiles de hidropatía, búsqueda de motivos).
-
Aplicaciones de estadística multivariada al análisis
de secuencias.
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IV. ALINEAMIENTO
DE 2 SECUENCIAS |
| 27/11 |
-
Conceptos básicos de identidad, similaridad y homología.
Construyendo matrices de puntajes (scoring matrices). Algoritmos de
alineamientos. |
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| 3/11 |
-
Transformando la similaridad-disimilaridad observada en distancias
(primera parte). |
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| 10/11 |
-
Algoritmos de alineamiento óptimo (globales y locales), bases
teóricas y uso de programas.
-
Algoritmos heurísticos de alineamientos: BLAST y FASTA. |
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V. ALINEAMIENTO
DE MÚLTIPLES SECUENCIAS |
| 17/11 |
-
Aspectos básicos del alineamiento múltiple.
- Diferencias con alineamientos de 2 secuencias.
-
Aspectos metodológicos del alineamiento múltiple.
- Uso de diferentes programas.
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VI. ANÁLISIS
FILOGENÉTICO |
| 24/11 |
-
Introducción a la reconstrucción filogenética.
Métodos basados en matrices de distancias. Métodos de
parsimonia máxima. |
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| 1/12 |
-
Reconstrucción filogenética,métodos de máxima
verosimilitud, métodos Bayesianos.
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diapos2 |
VII. ESTRUCTURA
DE PROTEÍNAS |
| 8/12 |
-
Estructura de proteínas. Estructura secundaria, estructura
terciaria.
- Programas de visualización. |
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